맞춤형 화장품제조관리사 시험은 실기 없이 필기만으로 시행된다. 총 4과목으로 '화장품법의 이해, 화장품 제조 및 품질관리, 유통화장품의 안전관리, 맞춤형화장품의 이해'이며 과목마다 문항유형과 출제 수 및 총점에는 차이가 있다. 각 시험 과목에서 출제되는 세부 항목들은 아래와 같다.
 

① '화장품 관련 법령 및 제도 등에 관한 사항'에서 출제되는 '화장품법'에서는 화장품법의 입법취지와 정의 및 유형, 유형별 특성, 영업종류, 품질요소, 사후관리 기준에 대한 항목이, 개인정보 보호법에서는 고객관리 프로그램 운용과 개인정보보호법에 근거한 고객정보 입력·관리·상담의 항목들이 출제된다.. 객관식 7문제와 단답형 주관식 3문제로 10문제이며 총점은 100점이다. ② '화장품의 제조 및 품질관리와 원료의 사용기준 등에 관한 사항'에서는 화장품 원료와 종류와 특성(원료 종류, 성분 특성, 원료 및 제품의 성분정보),화장품의 기능과 품질(화장품 효과, 판매가능한 맞춤형화장품 구성, 내용물 및 원료의 품질성적서 구비), 화장품 사용제한 원료(사용제한 원료 종류와 사용한도, 착량제 성분 중 알러지 유발 물질), 화장품 관리(화장품 취급방법·보관·사용방법 및 주의사항), 위해사례 판단 및 보고(위해여부 판단, 위해사례 보고) 항목이 출제되며 객관식 20문항과 단답형 5문항으로 총점은 250점이다. ③ '화장품의 유통 및 안전관리 등에 관한 사항'에서는 작업장 위생관리(작업장 위생 기준·상태·유지관리 활동, 세제 종류와 사용법, 소독을 위한 소독제 종류 및 사용법), 작업자 위생관리(작업장 내 직원의 위생기준 설정·위생상태 판정, 혼합 및 소분 시 위생관리규정, 위생유지를 위한 세제·소독제 종류와 사용법, 복장 청결상태 판단),  설비 및 기준관리(설비·기구의 위생기준설정 및 상태판정, 오염물질 제거와 소독법, 설비·기궁의 구성재질 구분과 폐기 기준), 내용물 원료관리(내용물 및 원료의 입고 기준, 유통화장품의 안전관리 기준, 입고된 원료 및 내용물 관리기준, 보관중인 원료 및 내용물 출고기준, 내용물 및 원료의 폐기기준·사용기한 확인 및 판정·개봉 후 사용기간 확인과 판정·변질상태 확인·폐기절차), 포장재의 관리(포장재 입고기준, 입고된 포장재 관리기준, 보관중인 포장재 출고기준, 포장재 폐기기준, 포장재 사용기한 확인 ·판정, 개봉 후 사용기한 확인·판정, 포장재 변질상태 확인 및 폐기절차) 항목으로 객관식으로만 25문제가 출제되며 총점은 250점이다. ④ '맞춤형화장품의 특성·내용 및 관리 등에 관한 사항'에서는 맞춤형화장품 개요(정의, 주요규정, 안적성, 유효성, 안정성), 피부 및 모발 생리구조, 관능평가 방법과 절차, 제품상담(맞춤형화장품 효과, 부작용 종류와 현상, 배합금지 사항 확인·배합, 내용물 및 원료의 사용제한 사항), 제품안내(맞춤형화장품 표시사항·안전기준 주요사항·특징·사용법), 혼합 및 소분(원료 및 제형의 물리적 특성, 화장품 배합한도 및 금지원료, 원료 및 내용물의 유효성과 규격, 혼합과 소분에 필요한 도구·기기 리스트 선택과 사용, 맞춤형화장품 판매업 준수사항에 맞는 혼합 및 소분활동), 충진 및 포장(제품에 맞는 충진방법과 포장법, 용기 기재사항), 재고관리(원료 및 내용물의 재고파악, 적정 재고를 유지하기 위한 발주)는 객관식 28문항과 단답형 12문항으로 총점은 400점이다.