버섯관련 국가자격의 경우, 버섯종균기능사가 유일하였으나 2019년에 버섯산업기사가 버섯종균기능사의 상위자격으로 신설되었다. 버섯종균기능사 시험에는 응시자격 제한이 없어 연령, 학력, 경력에 관계없이 응시가 가능하지만 산업기사 시험은 일정 응시자격 조건을 갖추어야 한다. 기능사 취득 후 동일직무분야에서 일정 경력이 쌓이면 산업기사 응시가 가능해진다.

버섯종균기능사 자격시험은 1차 필기, 2차 실기로 시행된다. 필기는 '1. 종균제조 2. 버섯재배'로 두 과목이며 객관식 4지 선다형으로 실시된다. 2차 실기는 '버섯종균작업'으로 버섯종균제조 능력을 평가하며 두 시험 모두 1시간 동안 시행된다. 필기 및 실기 모두 100점 만점을 기준으로 60점 이상을 받아야 한다. 상대적으로 필기보다 실기의 합격률이 높은 편이다. 최근 2020~2021년도의 합격률을 확인해보면 필기는 각각 50%, 59.4%였고 실기의 평균 합격률은 72.5%, 89.2%였다.